亞東紀念醫院與台灣微軟、亞大基因科技（ATGENOMIX）三方合作，共同打造「亞東精準醫療永續平台」，將核心基因定序系統全面部署至Microsoft Azure台灣區域資料中心。 此舉不僅讓亞東醫院成為全台首家將此核心系統上雲的第一級醫學中心，更透過雲端強大的彈性算力，顯著提升基因分析效率，為台灣精準醫療領域立下新的里程碑。
NGS納入健保，基因定序成醫療核心
自2024年衛福部健保署將次世代基因定序（NGS）納入健保給付後，精準醫療在台灣的發展邁入新紀元，預估每年將有超過兩萬名癌症患者受惠。 醫師能藉由NGS檢測結果，為患者制定個人化的治療與用藥策略，提升治療成效。 然而，單次完整的基因定序會產生約100GB的龐大數據量，傳統的地端設備在處理與分析上常面臨效能瓶頸。
作為新北市的醫學中心，亞東醫院早已將基因定序視為未來醫療的核心方向，並在院內啟動「精準醫療計畫」，至今已累積超過一萬名受檢者的基因定序資料庫。
亞東醫院院長邱冠明表示：「亞東醫院正邁向數位轉型與精準醫學的時代，我們在疫情期間累積的基因數據已為就醫民眾的健康帶來更多保障。未來，我們將持續推動相關流程，並擴展至合作醫療機構，讓精準醫學深入社區。」
雲端架構驅動分析，效率提升16倍
為了解決龐大基因資料的運算需求，亞東醫院採用了亞大基因科技建構於Azure雲端平台上的Bio-IT服務Atgenomix Seqslab。 台灣微軟總經理卞志祥指出，此專案不僅是台灣醫學中心上雲的首例，更是亞洲首個將癌症與遺傳罕病基因定序分析運算建置在Azure上的案例。
透過雲端原生架構與GPU加速，平台在處理效能上獲得驚人突破。
聯合分析與變異點偵測
系統整合了NVIDIA Parabricks基因體分析套件，利用Azure NC8as_T4_v3虛擬機進行加速。在30倍深度的全基因定序（WGS）變異點偵測中，分析時間從傳統CPU所需的4小時大幅縮短至僅10分鐘。 對於2,500名受檢者的大規模聯合分析，處理時間更從過去需要一個月，減至僅40小時，效率提升高達16倍。
資料湖庫查詢效能
此平台整合了超過一萬名受試者、總計高達90億筆的變異資料，建構成一個龐大的資料湖庫（Data Lakehouse）。憑藉Azure高效的運算與儲存能力，臨床醫師的平均查詢等待時間從140秒降至12秒。 若以每月處理1,000筆查詢計算，可為臨床人員節省數十小時的寶貴時間。
亞大基因科技執行長張明台表示：「透過Microsoft Azure雲端平台，我們有效滿足了亞東醫院龐大且快速的運算需求，真正讓精準醫療落地臨床。」
資料落地台灣，兼顧合規與低延遲
將整個基因定序系統部署至微軟在台的區域資料中心，確保所有數據皆儲存於境內，完全符合台灣醫療法規與資安標準。 同時，就近調度雲端資源也有效降低了資料傳輸的延遲，讓分析工作能更即時啟動。
目前，此系統已應用於心血管疾病、神經系統疾病、罕見疾病等研究領域，協助醫師識別高風險族群，提供精準健康管理的依據。 未來，亞東醫院計畫將應用擴展至腸道菌基因與失智症關聯研究，持續朝向個人化精準醫療的目標邁進。
玩家總結
這次亞東醫院與微軟、亞大基因的合作，可說是一次教科書等級的「雲端算力」應用展示。過去聽起來遙不可及的基因定序，因為動輒數週到數月的分析時間而難以普及。如今透過雲端GPU加速，將一個月的運算壓縮到兩天內完成，這不僅是技術上的突破，更意味著「個人化醫療」時代的真正來臨。當醫師能以數秒鐘的時間查詢龐大的基因資料庫，不僅提升了診斷效率，也為病患爭取到最寶貴的治療時間。這也再次證明，頂尖的雲端技術正在以驚人的速度，改寫各行各業的遊戲規則。
新聞資料由台灣微軟提供
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